档案盒按照摆放方式的不同，可以分为竖式和横式两种。之所以设计横式档案盒，是为了增加盒内文件与档案盒的接触面，避免文件竖置时“头重脚轻”而发生弯曲折损。从长远考虑，档案盒横放更有利于档案的保护。
档案盒发展进入第二个时期，也就是无酸纸档案盒。
档案文件盒用的纸张含酸量的高低是其寿命的指标，无酸纸指的是用pH值为7.0或更高的做出的纸，使用寿命可长达两百年。
无酸纸档案盒：颜色均匀，色淡，纸张表面光洁平整。相较于早期的牛皮纸档案盒，它不褪色，不变质，防霉还防虫，因而能能够更好的进行档案管理，保障了档案的归档与科学分类，做到分工细化。
档案盒应根据摆放方式的不同，在盒脊或底边设置全宗号、年度、保管期限、起止件号、盒号等必备项，并可设置机构（问题）等选择项。其中，起止件号填写盒内件文件和后一件文件的件号，起件号填写在上格，止件号填写在下格；盒号即档案盒的排列顺序号，按进馆要求在档案盒盒脊或底边编制。
档案盒使用原则
将归档文件按顺序装入档案盒，并填写档案盒盒脊及备考表项目。不同年度、机构（问题）、保管期限的归档文件不能装入同一个档案盒。
1、不同形成年度的归档文件不能放入同一档案盒；
2、不同保管期限的归档文件不能放入同一档案盒；
3、放入同一档案盒的归档文件应按照档号先后进行排序，小号在前，大号在后；
4、档案盒盒脊和备考表的填写应与盒内档案的情况一致。